29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2503 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  100 
 
 		 202 aa  424  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.62 
 
 		 175 aa  241  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.5 
 
 		 186 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  62.5 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  76.34 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0005  YrkC  75.57 
 
 		 182 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2607  cupin domain protein  67.16 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2716  cupin domain protein  67.91 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00607762  normal  0.0576252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06210  mannose-6-phosphate isomerase  53.73 
 
 		 140 aa  165  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3262  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  53.72 
 
 		 129 aa  144  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.232764  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  52.03 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3146  cupin 2, barrel  42.59 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.515896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2361  cupin 2 protein  43.8 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.877822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  43.8 
 
 		 135 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 130 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1364  hypothetical protein  40.16 
 
 		 135 aa  97.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0905  cupin 2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 133 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.52502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 130 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 133 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  38.26 
 
 		 130 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  43.1 
 
 		 134 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  36.94 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  32.71 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  32.95 
 
 		 112 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 		 103 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.14 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>