36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3665 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  229  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  59.46 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  59.46 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  55.86 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  62.38 
 
 		 104 aa  133  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  51.52 
 
 		 118 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  35.58 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  45.21 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  32.67 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.65 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2503  cupin 2, barrel  32.95 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01258  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  29 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  28 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  30.09 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  31.88 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.05 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  32.86 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  30.88 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0006  YrkC  25.86 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 201 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  30.14 
 
 		 117 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>