27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08490 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  38.83 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  40.38 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  33.65 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  31.73 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  32.04 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  31.07 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.83 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  26.67 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  23.28 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.83 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.08 
 
 		 113 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.08 
 
 		 113 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  24.72 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  24.42 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  27.78 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 104 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>