62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2191 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2191  cupin region  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  56.88 
 
 		 110 aa  126  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.38 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  36.27 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  36.54 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  38.04 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  45.21 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  42.67 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  26.19 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  34.92 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  42.59 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.89 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.89 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  43.14 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  27.91 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  31.03 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  31.43 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  27 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.11 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  31.51 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  29.23 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  31.15 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  35.14 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  35.09 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.92 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  25.74 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1723  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.410123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  25.29 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  31.51 
 
 		 345 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  31.51 
 
 		 345 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  30.77 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  26.92 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  39.62 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  29.89 
 
 		 137 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  25 
 
 		 113 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>