81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  100 
 
 		 113 aa  223  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  33.71 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  36.78 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  32.58 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  35.96 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  31.82 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  29.36 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  32.58 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  39.71 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.58 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.58 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  34.09 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  30 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  39.13 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  29.07 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  29.27 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  28.24 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  32.1 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  26.19 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  28 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  26.14 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0852  hypothetical protein  27.27 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0782  hypothetical protein  28.41 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  32.94 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  28.57 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  28.05 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1179  hypothetical protein  24 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  29.21 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1252  hypothetical protein  25 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00699027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  29.63 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  39.58 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  25 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  39.33 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  25.61 
 
 		 124 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  31.11 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  25.3 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  25.64 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  36.51 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  28.24 
 
 		 115 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 110 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.1 
 
 		 111 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>