47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09790 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  40.4 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.4 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  38.38 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.4 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 
111 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  37.37 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 
111 aa  72  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  37.62 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  27.1 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 
121 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  25.59 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  32.41 
 
 
107 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  35.35 
 
 
121 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  34.51 
 
 
111 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  35.35 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  39.58 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  33.63 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  37.11 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 
113 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
113 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 
87 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 
115 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  34.31 
 
 
111 aa  61.6  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 
113 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  35.64 
 
 
111 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  33.64 
 
 
115 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 
116 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 
112 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 
112 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 
112 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  30.84 
 
 
124 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  32.38 
 
 
117 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
112 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 
118 aa  48.5  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  28.57 
 
 
113 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  30.43 
 
 
111 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
106 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  31.65 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.75 
 
 
112 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27 
 
 
124 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>