79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0782 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
115 aa  234  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.81 
 
 
111 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  71.26 
 
 
87 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.89 
 
 
118 aa  114  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.7 
 
 
113 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.95 
 
 
113 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  47.66 
 
 
112 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  44.23 
 
 
219 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  43.27 
 
 
214 aa  103  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  49.5 
 
 
114 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  47.47 
 
 
111 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  52.58 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  46.3 
 
 
117 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  52.13 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  48.51 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  48.48 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  42.45 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  45.92 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  46.32 
 
 
109 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  45.92 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.49 
 
 
110 aa  90.5  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.89 
 
 
110 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  42 
 
 
121 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  47.47 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  46.88 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.35 
 
 
111 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  42.27 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.82 
 
 
112 aa  84  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  41.84 
 
 
111 aa  84.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.24 
 
 
113 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  35.51 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  34.34 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  34.44 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  35.42 
 
 
219 aa  61.6  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27.96 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  34.72 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  30 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
503 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  25 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  30.67 
 
 
503 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  31.51 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  21.88 
 
 
106 aa  42  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.19 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.23 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  27.4 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
192 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  25.61 
 
 
110 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  32.1 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  34.29 
 
 
724 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.51 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  26.39 
 
 
199 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  29.35 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 
234 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.35 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 
197 aa  40  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 
182 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  21.88 
 
 
106 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>