60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0927 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 113 aa  229  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  82.41 
 
 		 111 aa  184  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  62.04 
 
 		 110 aa  148  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  62.96 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  62.04 
 
 		 110 aa  137  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  61.11 
 
 		 110 aa  136  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  60.19 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.19 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  61.11 
 
 		 277 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.95 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  54.72 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  53.7 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  50.91 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  51.89 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  50.93 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  51.89 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  51.89 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  47.17 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  47.71 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  49.07 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  41.35 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  38.89 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  37.38 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  41.67 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  37.38 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  39.53 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  36.84 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  34.38 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  30.53 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  38.67 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  31.4 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  32.86 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  29.73 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  30 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0151  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.08 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.320826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1091  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.08 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  34.67 
 
 		 115 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1004  cupin domain-containing protein  31.08 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1459  cupin domain-containing protein  31.08 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2315  cupin domain-containing protein  31.08 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1385  2,4'-dihydroxyacetophenone dioxygenase  31.08 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>