49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3238 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  217  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  63.89 
 
 		 110 aa  150  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  67.59 
 
 		 109 aa  146  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  66.06 
 
 		 111 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.06 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  61.82 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.89 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.09 
 
 		 111 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  60.91 
 
 		 277 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  60.55 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  60.55 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  60.55 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  58.49 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.82 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  51.89 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  55.96 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  55.05 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  56.48 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  62.04 
 
 		 113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  55.66 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  46.15 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  44.23 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  49.02 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  46.43 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  41.75 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  44.57 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  41.76 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  43.48 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  35.96 
 
 		 111 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  32.39 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  33.04 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  38.57 
 
 		 111 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 113 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  23.71 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  29.17 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  32.86 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  32.39 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>