70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1985 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  62.24 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.18 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.18 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  60.2 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  58.16 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  56.25 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  60.42 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.63 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  53.7 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  52.78 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  61.46 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  60.2 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.61 
 
 		 110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.58 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  51.89 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  53.19 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  46.36 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  47.66 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.04 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  49.02 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.54 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  46.39 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.88 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  40.82 
 
 		 214 aa  87.8  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  49.4 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.62 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.62 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  35.64 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  36.63 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.58 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  34.31 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  35.29 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.55 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  36.14 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  29.59 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  28.42 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  31.33 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  27.91 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  30.16 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  30.77 
 
 		 312 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  24.53 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.39 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 112 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 277 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  27.5 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 274 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  32.39 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  32.39 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  32.39 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>