115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2268 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  224  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  79.09 
 
 		 111 aa  176  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.63 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.42 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.57 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.39 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  40.57 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.58 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  35.24 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.26 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.95 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  35.79 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  36.96 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  38.3 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.71 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  30.1 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  37.36 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  38.26 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  37.36 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  34.07 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  40.22 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  30.77 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.49 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  30.1 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.79 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  27.59 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  33.82 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  32.1 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.88 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.9 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.9 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  29.76 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  29.09 
 
 		 235 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  30.16 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  33.93 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  30.59 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1661  2,4-dihydroxyacetophenone dioxygenase  32.32 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.883469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  36.51 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  27.03 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  27.69 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.743706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  38.18 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>