89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7186 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 109 aa  228  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.38 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.05 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.6 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  51.89 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  50.94 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  48.6 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  50 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.37 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  55.43 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  50.94 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.37 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  50.91 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  50.91 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.57 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  51.38 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.91 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  46.23 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  46.08 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  43.3 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  46.46 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  46.24 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  46.24 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.3 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  45.05 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.78 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.66 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.19 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  37.35 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  32.26 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2188  cupin 2 domain-containing protein  29.21 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000987781  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  33.33 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  32.26 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  29.03 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  30.85 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.37 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 182 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.88 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  29.58 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 139 aa  42  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  31.43 
 
 		 129 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1714  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  32.86 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  23.6 
 
 		 334 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>