74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3950 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  276  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  76.3 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.06 
 
 		 139 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.59 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  73.64 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  60.14 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  68.38 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  61.59 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  70.37 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.42 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.43 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  50 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  59.41 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.81 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  56.73 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  47.73 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.42 
 
 		 138 aa  123  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  55.14 
 
 		 143 aa  123  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.31 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.28 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  55.77 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.8 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.8 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  54.95 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  45.61 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  44.35 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  47.27 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  47.27 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  47.27 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  41.6 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  45.69 
 
 		 318 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  41.6 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  45.61 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  46.39 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  45.05 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  43.36 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  41.13 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  41.09 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  37.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  37.19 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  37.19 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  35.24 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  38.83 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.8 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  39.8 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  35.19 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.89 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  35.96 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2564  pirin domain-containing protein  40.85 
 
 		 247 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  40.28 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  35.62 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.62 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  26.98 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.91 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3276  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  39.44 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>