72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2380 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  54.84 
 
 		 148 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  51.26 
 
 		 157 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  47.29 
 
 		 147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 149 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  60.53 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  35.4 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  46.88 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  43.43 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.77 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.04 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  33.71 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.46 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  37.35 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  36.27 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  27.43 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  31.91 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  36.27 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  36.27 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  36.27 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  35 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.76 
 
 		 139 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.33 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  31.67 
 
 		 146 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  23.26 
 
 		 141 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 139 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  36.89 
 
 		 134 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  38.46 
 
 		 318 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  36.19 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 132 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.04 
 
 		 141 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  37.35 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  37.35 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  37.35 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  39.19 
 
 		 152 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  31.63 
 
 		 133 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  39.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.69 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  31.46 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  29.21 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  29.51 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  34.94 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  39.47 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  31.33 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 133 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  39.47 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  38.03 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 128 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 131 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  46.94 
 
 		 135 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  29.89 
 
 		 134 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 138 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 128 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  29.09 
 
 		 141 aa  41.6  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  37.5 
 
 		 150 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>