71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2017 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 143 aa  290  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  74.83 
 
 		 143 aa  221  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  52.86 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.71 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  59.81 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  58.88 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  59.81 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  58.88 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  56.07 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  44.76 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.23 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  48.95 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  49.25 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.7 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  52.17 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.43 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  55.17 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  50.85 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  45.39 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.72 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.79 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.49 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.31 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  41.98 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  50.57 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  38.28 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  42.55 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  43.96 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  35.59 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  42.55 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.3 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.82 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  47.13 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  47.13 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  47.13 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  39.36 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  47.13 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  36.29 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  36.29 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  34.62 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  35.2 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  36.89 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.35 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  30.83 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  30.69 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  30.09 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  35.16 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2564  pirin domain-containing protein  37.14 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  32.94 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  30.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  31.65 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  34.72 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>