93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  82.96 
 
 		 135 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  42.28 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  43.44 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  43.12 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  41.8 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  44 
 
 		 318 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  41.74 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.84 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.23 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  39.09 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  39.09 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  38.53 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  38.53 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  42.31 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.33 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.23 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  39.42 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.4 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  38.38 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  33.59 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  36.8 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  36.8 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  37.5 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  38.83 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  35.24 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  35.07 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  33.06 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  34.02 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  34.02 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  34.17 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  32.03 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.78 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.78 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  33.33 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.07 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  34.21 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  38.04 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.3 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.58 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.87 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  29.01 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  31.46 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  26.4 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  32.29 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  25.2 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  32.91 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  29.52 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 151 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 151 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  31.82 
 
 		 151 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>