70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4326 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  283  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  84.4 
 
 
139 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  84.4 
 
 
139 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  84.4 
 
 
139 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  82.3 
 
 
141 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  46.72 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  57.28 
 
 
152 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  51.26 
 
 
318 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  54.37 
 
 
155 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  43.07 
 
 
138 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  49.55 
 
 
138 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.65 
 
 
139 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  49.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  53.76 
 
 
150 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 
147 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  44.35 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  45.05 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  45.54 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  47.12 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  44.35 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.97 
 
 
139 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  43.93 
 
 
143 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  42 
 
 
135 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  39.81 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.12 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  42.45 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.57 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  41.51 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  42.45 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  37.76 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  37.5 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  44.32 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.2 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.03 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  38.61 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  42.55 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.63 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  32.54 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.17 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  33.09 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.73 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  37.78 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  35 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  34 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  31.31 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  39.53 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 
173 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  32.58 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  29.06 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  26.05 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1059  hypothetical protein  34.69 
 
 
151 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>