64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2774 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  87.68 
 
 		 138 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  75.18 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  68.79 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.38 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  64.66 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.42 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.41 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  62.32 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.17 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.16 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.16 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  58.39 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  50.74 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  57.41 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.09 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  58.33 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  48.53 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  49.25 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  54.81 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  53.39 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.56 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.07 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.62 
 
 		 179 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  48.62 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  35.77 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  42.86 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.39 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  40.82 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  39.45 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  39.45 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  39.09 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  40.82 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  35.04 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  39.02 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.21 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  39.8 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  37.61 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  36.36 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.38 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  38.21 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  35.54 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  34.81 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  36.89 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  33.59 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.24 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  38.18 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  35.65 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  36.36 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  35.87 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.86 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  35.45 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  35.42 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>