84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4626 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  98.47 
 
 		 131 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  98.47 
 
 		 131 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  89.55 
 
 		 134 aa  207  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  72.59 
 
 		 135 aa  203  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  85.45 
 
 		 139 aa  199  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.59 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  71.43 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.36 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  66.67 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  69.31 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  65.71 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  62.62 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  61.82 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.49 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  36.36 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  42 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  41.94 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  42.05 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  38.4 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  41.76 
 
 		 318 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  39.81 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  38.17 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  41.67 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.72 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  38.83 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  38.68 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  35.16 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  37.86 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.37 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  35.43 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  36.45 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  35.92 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  35.25 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  37.27 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  32.09 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.21 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.26 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  34 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.13 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.37 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  30.6 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.62 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.62 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  38.04 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  29.67 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  39.39 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  32.12 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  31.87 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  31.76 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.07 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  25.23 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  27.72 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  33.68 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  30.3 
 
 		 146 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>