156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2444 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  286  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  58.39 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 		 128 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.08 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.07 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  58.88 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  56.76 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  54.21 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  54.21 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.59 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  36.79 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  38.18 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.24 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  33.94 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  36.84 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  37.74 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  37.65 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  29.66 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  41.25 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  36.11 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  31 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.66 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.25 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  45.9 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  33.71 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  30.91 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  33.94 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  33.94 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  33.94 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.92 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  29.31 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 		 318 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  28.92 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  42.65 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8090  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.958297  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  34.38 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  24.48 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  28.41 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3731  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  36.21 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  32.56 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 		 231 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 193 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  32.56 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.61 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.21 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  33.02 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  40.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>