More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3731 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3731  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  524  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  34.87 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0750  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 450 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 292 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 277 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 277 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  31.7 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  30.24 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  30.28 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  29.74 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  31.48 
 
 		 295 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.44 
 
 		 268 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 333 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.88 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>