More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2200 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  63.88 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  60.84 
 
 		 273 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 279 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  51.21 
 
 		 281 aa  278  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 266 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 266 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 325 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 325 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  47.43 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 274 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  45.24 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  44.58 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 267 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  44.62 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  42.17 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 261 aa  222  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  42.8 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  41.29 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.91 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  40.91 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  41.27 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  40.53 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  43.67 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  43.23 
 
 		 270 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  33.73 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 270 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 266 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 267 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  40.09 
 
 		 260 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 257 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.01 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  37.12 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  41.37 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  37.75 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>