More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3816 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  94.36 
 
 		 266 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  90.7 
 
 		 268 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  52.12 
 
 		 284 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  54 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  49.59 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  44.53 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  46.39 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  44.8 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 267 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 277 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  41.15 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  46.02 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  43.81 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  41.85 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  39.91 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  33.78 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.37 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 273 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.94 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  36.94 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  38.84 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  38.84 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 261 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  36.1 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  31.87 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  35.22 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  35.75 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 254 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>