More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0022 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  82.49 
 
 		 275 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 257 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  52.28 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  48.95 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  43.7 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 265 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  43.7 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 310 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.55 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 280 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 275 aa  185  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  44.54 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  40.83 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.33 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  42.68 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 284 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  42.73 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.73 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  42.34 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  42.34 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  41.44 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  37.84 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 450 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2339  transcriptional regulator, AraC family  39.67 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 274 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  37.77 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>