More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4421 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  64.17 
 
 		 282 aa  335  5.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  50.39 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  53.07 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  53.07 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  47.57 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  48.29 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  45.02 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  45.68 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 325 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 325 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  44.18 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  43.67 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  42.26 
 
 		 274 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  46.52 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  39.52 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  42.08 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.47 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 263 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  40.47 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  32.52 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 270 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 322 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.12 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  37.6 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  34.96 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  35.18 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>