More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1773 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
267 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  90.84 
 
 
263 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  90.84 
 
 
263 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  91.15 
 
 
262 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  90.38 
 
 
262 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  89.69 
 
 
263 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  81.92 
 
 
262 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  70.87 
 
 
268 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  71.88 
 
 
902 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  71.88 
 
 
280 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  71.48 
 
 
294 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  71.09 
 
 
280 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  71.09 
 
 
280 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  57.48 
 
 
270 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  55.25 
 
 
276 aa  270  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  53.7 
 
 
261 aa  262  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  47.66 
 
 
267 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  47.6 
 
 
265 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  47.58 
 
 
278 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  42.68 
 
 
283 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 
278 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  42.79 
 
 
273 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 
254 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  41.52 
 
 
278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  40.36 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 
257 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
273 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.65 
 
 
256 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 
284 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 
255 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  38.29 
 
 
264 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
266 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
266 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 
244 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
275 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  36.94 
 
 
281 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 
257 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 
267 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  44.89 
 
 
247 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  41.63 
 
 
293 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 
287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 
257 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 
288 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  40.89 
 
 
260 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 
278 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
303 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 
333 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
259 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
283 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 
273 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 
274 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  41.7 
 
 
270 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 
322 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 
277 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 
267 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
272 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
257 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  37.95 
 
 
292 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
279 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  34.16 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 
325 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 
325 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 
294 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 
241 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 
248 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
284 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
293 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
293 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 
249 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
293 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 
267 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  39.91 
 
 
274 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  38.12 
 
 
261 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  41.59 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>