More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1285 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  52.57 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  44.98 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  43.95 
 
 		 254 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  36.29 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 270 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  37.86 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 259 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  37.84 
 
 		 902 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  33.47 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.84 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  35.89 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 325 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  36.4 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  35.75 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  36.61 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 272 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>