More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3229 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  37.73 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36.68 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.24 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.77 
 
 		 278 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  37.83 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  31.7 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  30.32 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  33.2 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  29.86 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  27.6 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  33.91 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2339  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1490  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 197 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107689  normal  0.0449823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>