More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  90.2 
 
 		 254 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  44.98 
 
 		 293 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 270 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  37.95 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 288 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  37.6 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  34.72 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  42.44 
 
 		 902 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  39.15 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  34.58 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  39.01 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  34.8 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  33.61 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  40.43 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 295 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1490  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107689  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 303 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  36.56 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>