More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0784 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 257 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 241 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  43.42 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  42.08 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  42.15 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  47.32 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  41.52 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 450 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  42.08 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  36.13 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  41.63 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  40.36 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  41.85 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  40.09 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  42.79 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  39.5 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  44.49 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>