More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1910 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  80.83 
 
 		 283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 280 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  79.7 
 
 		 280 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  79.32 
 
 		 280 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  70.72 
 
 		 270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  70.72 
 
 		 270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 270 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.13 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.87 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 257 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 450 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 287 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  33.86 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  33.48 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  36.52 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>