More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3166 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  60.74 
 
 
253 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  55.37 
 
 
260 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  50.84 
 
 
253 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  47.66 
 
 
277 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
277 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
277 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  42.74 
 
 
257 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
272 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
275 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
310 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  42.21 
 
 
262 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  42.21 
 
 
262 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
241 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
247 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  44.77 
 
 
255 aa  188  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  41.15 
 
 
257 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  44.14 
 
 
248 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  39.26 
 
 
265 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
255 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 
283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 
283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 
259 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  44.49 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 
303 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.65 
 
 
256 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
266 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
266 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 
322 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.74 
 
 
281 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 
255 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37.13 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
236 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 
265 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
271 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 
236 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  39.83 
 
 
257 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 
265 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 
279 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 
261 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
262 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.64 
 
 
263 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 
264 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  38.08 
 
 
268 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
291 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 
267 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 
244 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 
262 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.65 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.19 
 
 
267 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
284 aa  161  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 
264 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  37.15 
 
 
274 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 
265 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 
262 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  35.54 
 
 
265 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 
268 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
262 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 
262 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
278 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 
292 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 
288 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 
247 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  37.05 
 
 
278 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
284 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
261 aa  154  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 
292 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
293 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
293 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.25 
 
 
270 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 
263 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 
270 aa  151  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 
282 aa  151  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 
287 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 
286 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
287 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
287 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
287 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
287 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
287 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
297 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
266 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
274 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 
295 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 
258 aa  148  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>