More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0172 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  55.38 
 
 		 270 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  42.8 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  42.28 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  42.28 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  41.2 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 283 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  39.17 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 287 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 287 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 287 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 287 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 287 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  41.92 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 450 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  38.39 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  38.21 
 
 		 296 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  40.36 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.46 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 268 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  37.19 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  37.55 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.14 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>