More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001495 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  100 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 278 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 278 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  34.96 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  34.8 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.2 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  36.94 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 271 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.33 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  34.73 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 333 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 322 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 450 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  32.44 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>