More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  92.78 
 
 		 264 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 257 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 262 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 264 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 261 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  39.33 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  40.42 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  38.98 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  40.17 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  41.42 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  41.8 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  42.8 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  42.8 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  41.39 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  41.84 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  39.45 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  41.74 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  36.61 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  39.75 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  35.68 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  36.6 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.55 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  34.96 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  35.14 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>