More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3380 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 258 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  98.84 
 
 		 258 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  98.84 
 
 		 272 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  98.06 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  86.82 
 
 		 259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  85.66 
 
 		 259 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  86.05 
 
 		 259 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  82.95 
 
 		 259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  82.95 
 
 		 259 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  53.7 
 
 		 276 aa  291  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  53.33 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  56.07 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 257 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  37.94 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  35.8 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 277 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.86 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.13 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.91 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 287 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  32.44 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  28.87 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  31.3 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 291 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  27.09 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>