More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4909 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  49.6 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  45.66 
 
 		 271 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  45.66 
 
 		 272 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001035  transcriptional regulator AraC/XylS family  46.85 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2080  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  45.56 
 
 		 268 aa  234  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  34.45 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.36 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.88 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.05 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 266 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  33.19 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  34.08 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 273 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  31.4 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  32.91 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.84 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>