More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3608 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  98.52 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  98.52 
 
 		 272 aa  550  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  90.77 
 
 		 292 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001035  transcriptional regulator AraC/XylS family  56.04 
 
 		 271 aa  316  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2080  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  53.96 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  45.66 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  45.87 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.92 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  30.24 
 
 		 278 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 272 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  31.45 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0058  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.91 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  32.91 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>