More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1308 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  40.44 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.05 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  39.34 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 285 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 294 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  38.43 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  38.15 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 450 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 258 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  39.83 
 
 		 280 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  36.86 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 286 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.29 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  36.44 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2339  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 325 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 325 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  35.8 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>