More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2259 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 285 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 450 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  43.03 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  42.63 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  46.22 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  46.22 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  44 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  47.11 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  42.99 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 241 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  42.51 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  41.7 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.84 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 283 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 277 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 277 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.19 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  36.32 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  35.18 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  36.32 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  36.32 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 286 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  40.73 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>