More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50040 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  84.17 
 
 		 259 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  38.21 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  38.19 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.8 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  35.54 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  36.49 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 281 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  34.98 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 293 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  40.69 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  39.48 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  38.84 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 311 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0262  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  35.77 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 325 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 292 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 325 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.91 
 
 		 270 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 297 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>