More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04860 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 258 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  48.63 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  50 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  46.48 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0262  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  41.35 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  31.17 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 278 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  29.39 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 287 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.05 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  29.91 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  32.46 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>