More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  90.67 
 
 		 295 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 284 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 294 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 325 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 325 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  51.98 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  52.44 
 
 		 273 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  50.41 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  46.18 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.37 
 
 		 273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  47.37 
 
 		 273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  46.99 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  46.96 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  46.56 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  44.49 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  45.75 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  42.8 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 279 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  42.68 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  39.11 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.36 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 249 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37.55 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  35.83 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>