More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1666 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  69.88 
 
 
273 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  69.88 
 
 
273 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  69.88 
 
 
273 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  69.5 
 
 
269 aa  353  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  69.88 
 
 
273 aa  353  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  69.88 
 
 
272 aa  352  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  69.11 
 
 
269 aa  348  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  57.25 
 
 
294 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  56.86 
 
 
325 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  56.86 
 
 
325 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  54.65 
 
 
264 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  53.41 
 
 
267 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  52.02 
 
 
273 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  52.99 
 
 
278 aa  278  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  51.42 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  48.62 
 
 
284 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  51.84 
 
 
274 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  47.77 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  50.2 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  47.77 
 
 
258 aa  248  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  47.81 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  48.39 
 
 
292 aa  242  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
263 aa  235  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  43.5 
 
 
273 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 
273 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  47.83 
 
 
262 aa  222  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  43.5 
 
 
273 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  41.98 
 
 
273 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  42.29 
 
 
281 aa  210  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 
273 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 
284 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 
280 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 
268 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  42.69 
 
 
278 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  42.13 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  41.15 
 
 
282 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 
266 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 
267 aa  195  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
277 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  38.43 
 
 
248 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 
247 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 
267 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 
264 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 
262 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
262 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 
264 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
262 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  34.96 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  35.27 
 
 
260 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
263 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
267 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 
262 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 
247 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 
262 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 
278 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.59 
 
 
267 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
276 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
278 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 
261 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  37.05 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
259 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
273 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 
293 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 
257 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 
287 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 
293 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
263 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 
293 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 
267 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.26 
 
 
261 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>