More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0885 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  73.61 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  73.23 
 
 		 273 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 280 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  50.79 
 
 		 281 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 266 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  48.29 
 
 		 278 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 282 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 274 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  48.47 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  46.72 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 284 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  48.25 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  43.43 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  39.04 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.76 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  39.76 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  42.79 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 275 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  38.17 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  38.65 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  34.67 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  37.6 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.84 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>