More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3128 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  70.22 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  55.82 
 
 		 270 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 262 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  53.7 
 
 		 902 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 294 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  45.38 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  46 
 
 		 278 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  43.37 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 280 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  44.49 
 
 		 254 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  39.01 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  43.81 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  42.04 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  37.3 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.92 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 275 aa  161  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  35.6 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 241 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  38.22 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  41.15 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  40.72 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>