More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0944 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 280 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  98.91 
 
 		 280 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  98.91 
 
 		 280 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  99.63 
 
 		 902 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  71.48 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  72.83 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  69.85 
 
 		 262 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  69.85 
 
 		 262 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  70.66 
 
 		 263 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  47.51 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  41.87 
 
 		 283 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  40.78 
 
 		 278 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  43.62 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  43.61 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  41.45 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.77 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  40.17 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  40.27 
 
 		 265 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  35.86 
 
 		 264 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  44.14 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  41.59 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 241 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  41.63 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 266 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.55 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  35.98 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  35.98 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  36.25 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 257 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  33.04 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>