More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3870 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 265 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  47.51 
 
 		 902 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  42.28 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  38.5 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  35.25 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.07 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.28 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.21 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  39.65 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  35.55 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.27 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 273 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 249 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>