More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01153 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  52.57 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 257 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  44.8 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  37.78 
 
 		 264 aa  178  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 		 265 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  43.42 
 
 		 255 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  37.6 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  40.09 
 
 		 273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  41.59 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  42.19 
 
 		 902 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  44.3 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.37 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  38.17 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  37.39 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  39.82 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 		 264 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.37 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  38.77 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 260 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 265 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  40.27 
 
 		 260 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  39.01 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 325 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 325 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>