More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2055 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 282 aa  564  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  64.17 
 
 		 278 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  59.04 
 
 		 277 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  49.41 
 
 		 281 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  48.4 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  45.56 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  40.16 
 
 		 258 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 267 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  39.31 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.31 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  39.31 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  41.2 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  32.02 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 262 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  33.47 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  35.34 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.4 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>